Todo material que sirve como soporte a una expresión histórica y da testimonio de la gestión administrativa de una institución pública está irremediablemente condenado al envejecimiento y, si no se interviene con oportunidad, al deterioro y a una pérdida inevitable. Esta situación ha obligado al archivo a instrumentar una estrategia de recuperación de los archivos generados por la Comisión Nacional del Agua en el Distrito Federal y en algunas Delegaciones Estatales.