El objetivo de crear una biblioteca como parte del Archivo Histórico del Agua respondió a la concepción general del proyecto de formación de este archivo, es decir, abrir un espacio institucional no sólo para el rescate y la organización documental sino también para el fomento de investigaciones originales sustentadas en material bibliográfico relacionado con el tema o región de estudio. A partir de esta concepción general se derivaron los criterios para la selección de material.

En primera instancia, fue importante contar con materiales útiles para reconstruir la historia de los aprovechamientos hidráulicos en nuestro país, específicamente sobre usos del agua en México, de allí que la biblioteca resguarde memorias, informes, monografías, legislación, estadísticas, atlas, geografías, tesis, informes del valle de México, la cuenca del Lerma-Chapala-Santiago. Asimismo, se consideró pertinente que si el acervo se integraba únicamente con este tipo de obras se corría el riesgo de integrar una biblioteca sumamente limitada.

Este acervo se ha incrementado de manera gradual y sistemática por las solicitudes que hemos realizado de donaciones institucionales y personales, siendo el intercambio bibliotecario y de publicaciones periódicas un aspecto fundamental en este proceso. La biblioteca ha incorporado nuevos títulos al acervo vía donaciones y convenios de canje, así como materiales publicados por organismos internacionales, así como de instituciones académicas que han realizado investigaciones en torno al agua, lo que ha enriquecido la biblioteca. Tambén, es importante señalar que los materiales bibliohemerográficos están ordenados y sistematizados en Logicat (Software para automatización de bibliotecas), con el cual se actualizan las bases de datos sobre materiales bibliohemerográficos de reciente adquisición.

De 1994 a la fecha se ha atendido la demanda de información de un nutrido grupo de usuarios provenientes de diversas instituciones de educación superior e investigación, empleados de la Comisión Nacional del Agua y público en general.